巴东县有2个乡、10个镇。巴东县，隶属湖北省恩施土家族苗族自治州，位于湖北省西南部，长江中上游两岸，恩施土家族苗族自治州的东北部。巴东县地形狭长，西高东低，南北起伏。地表崎岖，山峦起伏，峡谷幽深，沟壑纵横，是典型的喀斯特地貌。
巴东县位于亚热带季风区，温暖多雨，湿热多雾，四季分明。县域辖2个乡、10个镇，分别为：
1、金果坪乡
金果坪乡，隶属于湖北省恩施土家族苗族自治州巴东县，地处巴东县南部，东与水布垭镇为邻，南与鹤峰县邬阳乡接壤，西北与建始县官店镇毗连，北濒清江与清太坪镇隔江相望，区域总面积.28平方千米。金果坪乡辖14个行政村，乡人民政府驻思源路37号。
金果坪乡，明末清初，属容美土司地。清宣统三年（年）至民国二十年（年），为右六区中金果区。年1月，建金果坪。
2、溪丘湾乡
溪丘湾乡，隶属于湖北省恩施土家族苗族自治州巴东县，地处巴东县北部，东南与秭归县水田坝乡接壤，南与东瀼口镇相连，西南与官渡口镇毗邻，区域总面积.53平方千米。溪丘湾乡辖31个行政村，乡人民政府驻溪丘湾村。
溪丘湾乡，春秋时期，属夔子国地。隋朝，属巴东县。民国十九年（年），巴归兴苏维埃政府。年，设溪丘湾乡。
3、清太坪镇
清太坪镇，隶属于湖北省恩施土家族苗族自治州巴东县，地处巴东县西南部，东南与水布垭镇为邻，南濒清江与金果坪乡隔江相望，西与建始县石马乡和大支坪镇毗邻，北与野三关镇接壤，区域总面积.23平方千米。清太坪镇辖1个社区、31个行政村，镇人民政府驻清平街。
清太坪镇，明末清初，属容美土司地。民国二十年（年），为清太区。民国三十年（年），为南潭区署。年，为清太坪镇。
4、水布垭镇
水布垭镇，隶属于湖北省恩施土家族苗族自治州巴东县，地处巴东县南部，清江中游，东与长阳县渔峡口镇、枝柘坪镇为邻，南与金果坪乡和五峰县牛庄乡接壤，西与清太坪镇相邻，北与野三关镇毗邻，区域总面积.78平方千米。水布垭镇辖2个社区、28个行政村，镇人民政府驻武落钟离路。
水布垭镇，明末清初，属容美土司地。清宣统三年（年）至民国二十年（年），为清太区。民国三十年（年），为南潭区署。年3月，撤杨柳池镇入水布垭镇。
5、野三关镇
野三关镇，隶属于湖北省恩施土家族苗族自治州巴东县，地处巴东县东南部，东与长阳县榔坪镇为邻，东、东南与长阳县渔峡口镇、巴东县水布垭镇、清太坪镇接壤，西与大支坪镇毗邻，北与绿葱坡镇、长阳县磨坪乡相邻，区域总面积.14平方千米。野三关镇辖7个社区、26个行政村，镇人民政府驻创业路。
野三关镇，宋雍熙元年（年），属劝农亭。明未清初，属容美土司地。清雍正八年（年），改野三关。年，为野三关镇。
6、大支坪镇
大支坪镇，隶属于湖北省恩施土家族苗族自治州巴东县，地处巴东县西南部，东、东南与野三关镇、清太坪镇毗邻，南、西南与建始县高坪镇、龙坪乡隔河相望，北与绿葱坡镇接壤，区域总面积.78平方千米。大支坪镇辖15个行政村，镇人民政府驻大支坪村。
大支坪镇，明末清初，属容美土司地。民国元年（年）初至民国二十年（年），为大支区。民国二十五年（年），为野三关区。年11月，设大支坪镇。
7、绿葱坡镇
绿葱坡镇，隶属于湖北省恩施土家族苗族自治州巴东县，地处长江以南、清江以北的巴东县中部，东与秭归县磨坪乡为邻，南与野三关镇、大支坪镇接壤，西与建始县龙坪乡、重庆市巫山县雪花乡毗邻，北与茶店子镇相邻，区域总面积.63平方千米。绿葱坡镇辖1个社区、21个行政村，镇人民政府驻平安路18号。
绿葱坡镇，民国元年（年），属思阳区。年，撤区建绿葱坡镇。
8、茶店子镇
茶店子镇，隶属于湖北省恩施土家族苗族自治州巴东县，地处长江以南、巴东县城南部，东与秭归县梅家河乡为邻，南与绿葱坡镇毗邻，西与重庆市巫山县笃坪乡相邻，北与官渡口镇、信陵镇接壤，区域总面积.26平方千米。茶店子镇辖32个行政村，镇人民政府驻茶店子村号。
茶店子镇，春秋时期，属夔子国地。晚清时期，属安居里。年，更名茶店子镇。
9、官渡口镇
官渡口镇，隶属于湖北省恩施土家族苗族自治州巴东县，位于巴东县北部，东与东瀼口镇相邻，南濒长江，西南与茶店子镇接壤，西与重庆市巫山县培石乡、田家乡、月池乡为邻，北与沿渡河镇、溪丘湾乡毗邻，区域总面积.62平方千米。官渡口镇辖6个社区、35个行政村，镇人民政府驻太矶头滨江大道号。
官渡口镇，春秋时期，属蘷子国地。南朝，置归乡县。北周时期，改乐乡。隋朝，属巴东。1年，为官渡口镇。
10、沿渡河镇
沿渡河镇，隶属于湖北省恩施土家族苗族自治州巴东县，地处长江以北，巴东县北部，东与兴山县相邻，东南与溪丘湾乡毗邻，南连官渡口镇、西与重庆市巫山县楚阳乡接壤，北与神农架林区为邻，区域总面积.63平方千米。沿渡河镇辖3个社区、36个行政村，镇人民政府驻孔堡村。
沿渡河镇，晚清时期，属长丰里。民国二十年（年），属长丰区。1年5月，为沿渡河镇。
11、东瀼口镇
东瀼口镇，隶属于湖北省恩施土家族苗族自治州巴东县，地处巴东县北部，东与秭归县泄滩乡相邻，南濒长江，西与官渡口镇接壤，北与溪丘湾乡毗邻，区域总面积.06平方千米。东瀼口镇辖2个社区、14个行政村，镇人民政府驻雷家坪村。
东瀼口镇，民国二十一年（年），为巴东第二区公所。年7月，改为东瀼口镇。
12、信陵镇
信陵镇，隶属于湖北省恩施土家族苗族自治州巴东县，地处巴东县北部，东与秭归县沙镇溪镇为邻，南和茶店子镇接壤，西与官渡口镇一衣带水，北濒长江，区域总面积87.69平方千米。信陵镇辖7个社区、9个行政村，镇人民政府驻朝阳路12号。
信陵镇，春秋时期，属夔子国地。梁朝，改信陵郡。隋朝，更名巴东。民国二十五年（年），第一区署。1年，改信陵镇。