莲都区有5个乡、4个镇。莲都区，浙江省丽水市辖区，浙西南地区政治、经济、文化中心。全区总面积平方公里，是丽水市人民政府所在地。莲都区名的由来是因丽水城依山傍溪，在环山之中，形如莲瓣，宋代以后别名莲城，丽水又特产“处州白莲”，定“莲都”为市辖区区名，意欲将美丽的莲都建成繁华的都市。
莲都区气候属中亚热带季风气候类型，境内辖5个乡、4个镇、6个街道。其中，莲都区下辖的5个乡、4个镇，分别为：
1、峰源乡
峰源乡，隶属于浙江省丽水市莲都区，地处莲都区南部，东邻青田县祯旺乡，东南、南与景宁畲族自治县九龙乡、渤海镇、红星街道相连，西南、西与云和县元和街道、石塘镇相邻，北与大港头镇接壤，东北连接青田县章村乡，辖区总面积.14平方千米。峰源乡下辖8个行政村，峰源乡政府驻庞山村下园自然村。
峰源乡，清代，属元和乡十八都。年8月，郑地乡并入。
2、太平乡
太平乡，隶属于浙江省丽水市莲都区，地处莲都区中部偏北，东与仙渡乡、白云街道相邻，南连联城街道，南、西接老竹畲族镇，西北邻金华市武义县大溪口乡、新宅镇，北、东北与雅溪镇相连，辖区总面积.57平方千米。太平乡下辖19个行政村，镇人民政府驻太平村。
太平乡，民国三十八年（年）7月，设平（土夭）乡。年8月，巨溪乡并入。
3、仙渡乡
仙渡乡，隶属于浙江省丽水市莲都区，地处莲都区东北部，东连缙云县东渡镇，东南邻双黄乡，南、西南接岩泉街道、白云街道、太平乡，西、西北接雅溪镇，北、东北邻缙云县新建镇、七里乡，辖区总面积64.14平方千米。仙渡乡下辖11个行政村，乡人民政府驻葛畈村。
仙渡乡，年，属仙渡、芦南2个乡，隶属太平区；后归属雅溪区。年，撤销皂树乡，并入仙渡乡。
4、黄村乡
黄村乡，隶属于浙江省丽水市莲都区，地处莲都区东部，东与缙云县石笕乡相接，南连青田县舒桥乡，西南与紫金街道接壤，西接岩泉街道、双黄乡，北、东北与缙云县东渡镇、方溪乡毗连。辖区总面积.47平方千米。黄村乡下辖11个行政村，乡人民政府驻黄村村86号。
黄村乡，年，属信孝、池岭、戈剳乡。年，严鸟乡并入。
5、丽新畲族乡
丽新畲族乡，隶属于浙江省丽水市莲都区，地处莲都区西部，东与老竹畲族镇、联城街道接壤，东南接高溪乡，南、西与松阳县板桥畲族乡、象溪镇、三都乡相连，西北、北与金华市武义县三港乡接壤，辖区总面积79平方千米。丽新畲族乡下辖9个行政村，乡人民政府驻欧岸村。
丽新畲族乡，明景泰三年（年），属宣平县崇义区懿德乡。年5月，属莲都区。
6、碧湖镇
碧湖镇，隶属于浙江省丽水市莲都区，地处莲都区中部偏西南，东与水阁街道为邻，东南接青田县章村乡，南连大港头镇，西与松阳县裕溪乡毗连，西北邻高溪乡，北与联城街道接壤，东北仍与水阁街道相邻，辖区总面积.99平方千米。碧湖镇下辖4个社区、43个行政村，镇人民政府驻行口村环北路40号。
碧湖镇，清代，属来仪、义靖、孝行乡；光绪年间属五都至十六都。年8月，联合乡并入。
7、大港头镇
大港头镇，隶属于浙江省丽水市莲都区，地处莲都区西南部，东连碧湖镇，东南邻青田县章村乡，南接峰源乡，西、西北与云和县石塘镇、松阳县裕溪乡毗连，北仍与碧湖镇相接，辖区总面积.02平方千米。大港头镇下辖1个社区、10个行政村，镇人民政府驻大港头村港和路17号。
大港头镇，清代，属元和乡十七都至二十都，清后属南乡南元区。年5月，北埠乡并入。
8、雅溪镇
雅溪镇，隶属于浙江省丽水市莲都区，地处莲都区北部，东邻缙云县新建镇，东南连仙渡乡，南、西南接太平乡，西、西北与金华市武义县新宅镇毗连，北、东北仍与缙云县新建镇相接，辖区总面积.64平方千米。雅溪镇下辖19个行政村，镇人民政府驻双溪村。
雅溪镇，清代，属懿德乡；清代后期属北乡北懿区。年8月，西溪、泄川乡并入，改设雅溪镇。
9、老竹畲族镇
老竹畲族镇，隶属于浙江省丽水市莲都区，地处莲都区西北部，东与太平乡毗邻，东、南与联城街道接壤，西南、西连丽新畲族乡，西北、北与金华市武义县三港乡、大溪口乡毗连，东北仍接太平乡。辖区总面积81.63平方千米。老竹畲族镇下辖12个行政村，镇人民政府驻老竹村镇前街号。
老竹畲族镇，清代，属崇义、新匀、新桥、永丰、梁周5个乡，隶属宣平县。年5月25日，永丰乡并人老竹畲族镇。
另外，莲都区还下辖6个街道，分别为：岩泉街道、紫金街道、白云街道、万象街道、联城街道、南明山街道。